Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSLPQ969D9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSLPQ969D9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSLPQ969D9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSLPQ969D9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSLPQ969D9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSLPQ969D9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSLPQ969D9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSLPQ969D9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSLPQ969D9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms