Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113Q902F9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms