Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CTTNBP2Q8WZ74 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms