Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP133Q8WUM0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP133Q8WUM0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP133Q8WUM0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP133Q8WUM0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP133Q8WUM0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP133Q8WUM0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP133Q8WUM0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP133Q8WUM0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP133Q8WUM0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms