Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC12Q8WUD4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms