Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VN1R17PQ8TDU5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms