Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAF3IP1Q8TDR0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF3IP1Q8TDR0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms