Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHD5Q8TDI0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHD5Q8TDI0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms