Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD1Q8NHV4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms