Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL2Q8NHH9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.5 ms