Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms