Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF548Q8NEK5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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