Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC112Q8NEF3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC112Q8NEF3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms