Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG8Q8ND04 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG8Q8ND04 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG8Q8ND04 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms