Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APCDD1LQ8NCL9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APCDD1LQ8NCL9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms