Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms