Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms