Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA1Q8N8W4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms