Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAF1Q8N7H5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAF1Q8N7H5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms