Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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