Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC170Q8IYT3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC170Q8IYT3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC170Q8IYT3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC170Q8IYT3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC170Q8IYT3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms