Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC105Q8IYK2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC105Q8IYK2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms