Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRSK2Q8IWQ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRSK2Q8IWQ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRSK2Q8IWQ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms