Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KSR1Q8IVT5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms