Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFNL1Q8IU54 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNL1Q8IU54 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNL1Q8IU54 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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