Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF13Q86YI8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF13Q86YI8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF13Q86YI8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF13Q86YI8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF13Q86YI8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms