Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF39Q86UA1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF39Q86UA1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms