Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX20Q7Z614 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX20Q7Z614 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
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