Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP45Q70EL2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP45Q70EL2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP45Q70EL2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP45Q70EL2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP45Q70EL2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP45Q70EL2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP45Q70EL2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP45Q70EL2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP45Q70EL2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP45Q70EL2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP45Q70EL2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP45Q70EL2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP45Q70EL2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP45Q70EL2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP45Q70EL2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP45Q70EL2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP45Q70EL2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP45Q70EL2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP45Q70EL2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP45Q70EL2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP45Q70EL2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP45Q70EL2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms