Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCD1Q6ZMY3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms