Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB1D4Q6XE38 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms