Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMFQ6X4W1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms