Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNT2Q6UVM3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNT2Q6UVM3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms