Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A10Q6U841 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms