Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms