Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBA3EQ6PEY2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBA3EQ6PEY2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBA3EQ6PEY2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TUBA3EQ6PEY2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA3EQ6PEY2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA3EQ6PEY2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA3EQ6PEY2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA3EQ6PEY2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA3EQ6PEY2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA3EQ6PEY2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA3EQ6PEY2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA3EQ6PEY2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms