Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8BQ6P9F7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms