Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASC4Q6P4E1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms