Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RGMBQ6NW40 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGMBQ6NW40 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms