Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN13Q6MZZ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPN13Q6MZZ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms