Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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