Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms