Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDE2Q6IQ49 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDE2Q6IQ49 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms