Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICL7

SLC35E4, Solute carrier family 35 member E4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E4Q6ICL7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35E4Q6ICL7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC35E4Q6ICL7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC35E4Q6ICL7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC35E4Q6ICL7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC35E4Q6ICL7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC35E4Q6ICL7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC35E4Q6ICL7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms