Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms