Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHEQ5VZ18 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHEQ5VZ18 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms