Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms