Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC18Q5T9S5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC18Q5T9S5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC18Q5T9S5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms