Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC183Q5T5S1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC183Q5T5S1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC183Q5T5S1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms