Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNJQ5T5M9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNJQ5T5M9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms