Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf220Q5T0J3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms